Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms