Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms