Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWQ6

UPF0505 protein C16orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BWQ6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms