Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp43Q8BUM9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp43Q8BUM9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms