Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTV2

Cpsf7, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf7Q8BTV2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf7Q8BTV2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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