Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms