Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQZ5

Cpsf4, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf4Q8BQZ5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf4Q8BQZ5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf4Q8BQZ5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf4Q8BQZ5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms