Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB5

Efemp1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp1Q8BPB5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Efemp1Q8BPB5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Efemp1Q8BPB5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms