Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Prpf18Q8BM39 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Prpf18Q8BM39 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Prpf18Q8BM39 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Prpf18Q8BM39 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Prpf18Q8BM39 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Prpf18Q8BM39 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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