Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp1Q8BJQ2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp1Q8BJQ2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp1Q8BJQ2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Usp1Q8BJQ2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Usp1Q8BJQ2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Usp1Q8BJQ2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Usp1Q8BJQ2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Usp1Q8BJQ2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Usp1Q8BJQ2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp1Q8BJQ2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp1Q8BJQ2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp1Q8BJQ2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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Usp1Q8BJQ2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp1Q8BJQ2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp1Q8BJQ2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp1Q8BJQ2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp1Q8BJQ2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp1Q8BJQ2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp1Q8BJQ2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp1Q8BJQ2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp1Q8BJQ2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp1Q8BJQ2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp1Q8BJQ2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp1Q8BJQ2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp1Q8BJQ2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp1Q8BJQ2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp1Q8BJQ2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp1Q8BJQ2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp1Q8BJQ2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp1Q8BJQ2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp1Q8BJQ2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp1Q8BJQ2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp1Q8BJQ2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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