Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp4f39Q8BGU0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms