Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4bQ8BGE6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4bQ8BGE6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4bQ8BGE6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4bQ8BGE6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Atg4bQ8BGE6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Atg4bQ8BGE6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Atg4bQ8BGE6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Atg4bQ8BGE6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4bQ8BGE6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4bQ8BGE6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Atg4bQ8BGE6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Atg4bQ8BGE6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms