Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BGC1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BGC1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BGC1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BGC1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGC1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGC1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGC1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGC1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGC1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGC1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BGC1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms