Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms