Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms