Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctdspl2Q8BG15 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms