Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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H2-M10.5Q85ZW7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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H2-M10.5Q85ZW7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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H2-M10.5Q85ZW7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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H2-M10.5Q85ZW7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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H2-M10.5Q85ZW7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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H2-M10.5Q85ZW7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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H2-M10.5Q85ZW7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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H2-M10.5Q85ZW7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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H2-M10.5Q85ZW7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.5Q85ZW7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M10.5Q85ZW7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M10.5Q85ZW7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M10.5Q85ZW7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M10.5Q85ZW7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M10.5Q85ZW7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M10.5Q85ZW7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M10.5Q85ZW7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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H2-M10.5Q85ZW7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M10.5Q85ZW7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M10.5Q85ZW7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M10.5Q85ZW7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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