Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms