Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh8Q80Y20 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh8Q80Y20 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh8Q80Y20 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh8Q80Y20 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh8Q80Y20 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh8Q80Y20 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh8Q80Y20 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh8Q80Y20 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh8Q80Y20 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh8Q80Y20 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh8Q80Y20 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh8Q80Y20 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh8Q80Y20 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh8Q80Y20 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh8Q80Y20 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh8Q80Y20 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh8Q80Y20 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh8Q80Y20 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh8Q80Y20 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh8Q80Y20 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh8Q80Y20 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh8Q80Y20 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh8Q80Y20 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh8Q80Y20 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh8Q80Y20 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms