Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ttc28Q80XJ3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ttc28Q80XJ3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ttc28Q80XJ3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ttc28Q80XJ3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ttc28Q80XJ3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ttc28Q80XJ3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ttc28Q80XJ3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms