Protein–RNA interactions for Protein: Q80VU4

Ntf4, Neurotrophin-4, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf4Q80VU4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ntf4Q80VU4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf4Q80VU4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms