Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ell3Q80VR2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ell3Q80VR2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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