Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms