Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

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Length 577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otop3Q80UF9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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