Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdc42bpbQ7TT50 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc42bpbQ7TT50 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc42bpbQ7TT50 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc42bpbQ7TT50 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc42bpbQ7TT50 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc42bpbQ7TT50 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc42bpbQ7TT50 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc42bpbQ7TT50 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc42bpbQ7TT50 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc42bpbQ7TT50 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc42bpbQ7TT50 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc42bpbQ7TT50 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc42bpbQ7TT50 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc42bpbQ7TT50 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc42bpbQ7TT50 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc42bpbQ7TT50 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc42bpbQ7TT50 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc42bpbQ7TT50 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc42bpbQ7TT50 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc42bpbQ7TT50 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc42bpbQ7TT50 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc42bpbQ7TT50 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc42bpbQ7TT50 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms