Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms