Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms