Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PhkbQ7TSH2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PhkbQ7TSH2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms