Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms