Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms