Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNV8

Defb34, Beta-defensin 34, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb34Q7TNV8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defb34Q7TNV8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms