Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms