Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rph3alQ768S4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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