Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SynmQ70IV5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SynmQ70IV5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms