Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp34Q6ZQ93 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp34Q6ZQ93 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp34Q6ZQ93 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp34Q6ZQ93 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp34Q6ZQ93 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp34Q6ZQ93 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp34Q6ZQ93 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp34Q6ZQ93 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp34Q6ZQ93 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp34Q6ZQ93 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp34Q6ZQ93 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp34Q6ZQ93 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp34Q6ZQ93 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp34Q6ZQ93 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms