Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ58

Larp1, La-related protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1Q6ZQ58 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Larp1Q6ZQ58 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms