Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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NinlQ6ZQ12 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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NinlQ6ZQ12 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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NinlQ6ZQ12 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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NinlQ6ZQ12 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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NinlQ6ZQ12 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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NinlQ6ZQ12 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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NinlQ6ZQ12 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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NinlQ6ZQ12 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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NinlQ6ZQ12 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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NinlQ6ZQ12 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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NinlQ6ZQ12 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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