Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms