Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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