Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim45Q6PFY8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms