Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFX8

Rimkla, N-acetylaspartylglutamate synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RimklaQ6PFX8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RimklaQ6PFX8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RimklaQ6PFX8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RimklaQ6PFX8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RimklaQ6PFX8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RimklaQ6PFX8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RimklaQ6PFX8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RimklaQ6PFX8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RimklaQ6PFX8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RimklaQ6PFX8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RimklaQ6PFX8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RimklaQ6PFX8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RimklaQ6PFX8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RimklaQ6PFX8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RimklaQ6PFX8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RimklaQ6PFX8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RimklaQ6PFX8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RimklaQ6PFX8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RimklaQ6PFX8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RimklaQ6PFX8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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