Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Scaf4Q6PFF0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms