Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms