Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms