Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sarm1Q6PDS3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sarm1Q6PDS3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms