Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mfsd13aQ6PDE8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms