Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms