Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gapvd1Q6PAR5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms