Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl2Q6PA06 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms