Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak2Q6P9N8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms